McGarrett descobre que o homem que matou seu pai ainda está vivo. O assassino amarra Chin Ho a uma bomba, o faz de refém, e, em troca, quer que o seu pedido de resgate seja cumprido.
Callen e Sam trabalham com o capitão da marinha Harmon Rabb Jr. para prender espiões a bordo do USS Allegiance; Hetty tenta neutralizar um ataque de míssil no Oriente Médio; Kensi e Deeks estão presos em uma unidade móvel da CIA no Iraque sob ataque.
Com múltiplos casos por resolver ao redor do planeta, a equipe é obrigada a se separar. Callen e Sam começam a trabalhar em Tel Aviv, enquanto Kensi se associa ao Agente do Departamento de Justiça, Lance Hamilton, em Los Angeles.
Callen e Sam precisam cuidar da proteção pessoal de um oficial aposentado da Marinha dos Estados Unidos, o Almirante Killbride, em um esforço para localizar um oficial de inteligência naval que está desaparecido.